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新型藥物篩選研發(fā)平臺(tái)——PROTAC

  • 2020-08-10 10:26
  • 作者:黃翰漾 孫媛媛 徐佳熹
  • 來(lái)源:中國(guó)食品藥品網(wǎng)

 

  隨著技術(shù)要求的不斷提升,在傳統(tǒng)新藥篩選技術(shù)的基礎(chǔ)上,一些新的藥物篩選平臺(tái)應(yīng)運(yùn)而生。本站將介紹五種新型藥物篩選研發(fā)平臺(tái),本篇介紹第二種——PROTAC。


什么是PROTAC(蛋白降解靶向聯(lián)合體)


  PROTAC,Proteolysis-targeting chimera,利用的是化合物降解靶向蛋白的方法。Raymond. Deshaies等人在2001年最早提出了PROTAC的概念,并成功設(shè)計(jì)并合成了第一批PROTAC雙功能分子用于降解甲硫氨酰氨肽酶2。


  細(xì)胞內(nèi)通過(guò)泛素化蛋白酶體途徑來(lái)清除需要被降解的特異蛋白。這個(gè)過(guò)程就像是細(xì)胞將不用的文件(異常蛋白質(zhì))交給秘書(shū)(E3酶)蓋上作廢章(泛素化),扔到碎紙機(jī)里(蛋白酶體)。


  該技術(shù)能夠使靶點(diǎn)從“不可成藥性”變成“可成藥性”。大多數(shù)小分子藥物或單抗需要結(jié)合酶的活性位點(diǎn)來(lái)發(fā)揮作用,但是對(duì)于那些無(wú)酶功能的蛋白,尤其那些缺乏酶活性或者表面缺乏成藥位點(diǎn)的蛋白,卻是無(wú)能為力的。然而,人類(lèi)細(xì)胞中80%以上的蛋白缺乏這樣的位點(diǎn),而PROTAC分子卻可以捕獲這些蛋白,并將其快速降解清除。


PROTAC技術(shù)平臺(tái)的優(yōu)勢(shì)


  屬于“事件驅(qū)動(dòng)”,不依賴(lài)“占位驅(qū)動(dòng)”。小分子抑制劑、大分子抗體,都需持續(xù)占據(jù)靶蛋白的活性位點(diǎn)以阻斷功能,屬于“占位驅(qū)動(dòng)”。PROTAC只是提供結(jié)合活性,觸發(fā)靶蛋白與E3酶結(jié)合從而引發(fā)降解,屬于“事件驅(qū)動(dòng)”,不依靠目標(biāo)占據(jù)來(lái)破壞靶蛋白功能,超越了小分子可能實(shí)現(xiàn)的效果。


  能夠靶向傳統(tǒng)難以成藥的蛋白。PROTAC不直接抑制目標(biāo)蛋白的功能活性,藥物不需要與目標(biāo)蛋白長(zhǎng)時(shí)間和高強(qiáng)度的結(jié)合,因此可以靶向傳統(tǒng)難以成藥的蛋白。在已被解析的疾病相關(guān)蛋白中,有高達(dá)80%的蛋白無(wú)法用現(xiàn)有藥物去靶向,利用PROTAC技術(shù),理論上只要靶蛋白上有裂縫、缺口等可以短暫“著力”的地方就行。


  用量小,催化劑量即可。小分子抑制劑作用于靶蛋白后抑制其的活性,并不能使其降解掉;而PROTAC分子可直接催化降解靶蛋白,只需催化劑量即可。


  克服耐藥性。小分子抑制劑作用靶蛋白后,可能會(huì)造成靶蛋白突變或者靶蛋白過(guò)表達(dá),進(jìn)而引起耐藥性,從而使小分子抑制劑失去的對(duì)靶蛋白的抑制功能;而PROTAC分子通過(guò)蛋白酶體途徑將靶蛋白降解掉,克服了耐藥性。


  高選擇性。研究表明,由于靶蛋白與E3泛素連接酶之間的協(xié)同作用,PROTAC分子可以在小分子抑制劑的基礎(chǔ)上提高其選擇性。


  低毒性。由于PROTAC降解蛋白只需催化的劑量即可,給藥濃度較低,較低的藥物濃度又降低了脫靶效應(yīng)產(chǎn)生的可能性,減少毒副作用。


平臺(tái)1


PROTAC技術(shù)平臺(tái)的挑戰(zhàn)


  三聯(lián)體成藥性。由于PROTAC是三部分組成的類(lèi)似啞鈴形分子,其水溶性、口服生物利用度、代謝穩(wěn)定性、透膜性、合成難度和成本、PK/PD等,依然是需要逐一克服的難題。


  有效形成三元復(fù)合物的同時(shí)有效激活降解系統(tǒng)。PROTAC發(fā)揮藥效必須與靶蛋白和E3酶形成有效的三元復(fù)合物,而此過(guò)程對(duì)PROTAC來(lái)說(shuō),如何控制濃度以避免藥物分子與靶蛋白和E3酶分別形成二元復(fù)合物(hook effect),以及充分考慮靶蛋白與E3酶接觸區(qū)域的電荷排斥和立體結(jié)構(gòu)排斥,顯得非常重要。而當(dāng)三元復(fù)合物形成后,能否有效降解,還需要與去泛素化酶以及靶蛋白重合成作斗爭(zhēng),直到達(dá)成一定程度的平衡。


  脫靶毒性及其檢測(cè),尤其長(zhǎng)期毒性和生殖毒性。積累E3連接酶的天然底物可能有不良毒性。此外研究表明,度胺類(lèi)藥物(沙利度胺、來(lái)那度胺、泊馬度胺)能靶向E3酶CRBN,因此針對(duì)PROTAC的設(shè)計(jì)經(jīng)常直接使用度胺類(lèi)的骨架。沙利度胺具有較強(qiáng)毒性,尤其生殖毒性,因此對(duì)于度胺類(lèi)骨架的PROTAC的毒性評(píng)價(jià)會(huì)更加全面。


PROTAC全球發(fā)展進(jìn)程(國(guó)內(nèi)外企業(yè))


  Arvinas:


  公司由PROTAC鼻祖Crews教授在2013年創(chuàng)建,是目前進(jìn)展最快的公司。公司當(dāng)前市值13.93億美元,2019年?duì)I業(yè)收入為4297.65萬(wàn)美元,同比增長(zhǎng)200.03%。


  PROTAC技術(shù)平臺(tái)目前已經(jīng)設(shè)計(jì)可口服給藥、跨越血腦屏障的PROTAC分子,未來(lái)目標(biāo)的是靶向“難成藥”靶點(diǎn)、拓展E3連接酶、提高成功率(現(xiàn)有成功率95%)和選擇性。


  研發(fā)管線由抗腫瘤藥物和神經(jīng)疾病藥物兩大部分組成。


  用于治療前列腺癌的雄激素受體降解劑ARV-110、用于治療乳腺癌的靶向雌激素受體的ARV471已經(jīng)進(jìn)入了Ⅰ期臨床試驗(yàn),目前Ⅰ期臨床安全性和藥代動(dòng)力學(xué)數(shù)據(jù)已公布,在體內(nèi)具有良好的耐受性。


  Kymera:


  Kymera成立于2016年,致力于發(fā)展蛋白降解治療技術(shù),建立了獨(dú)特的Pegasus平臺(tái)。


  研發(fā)管線由炎癥和腫瘤兩部分組成,主要針對(duì)IRAK4蛋白,IRAK4在先天免疫中起重要作用。


  公司設(shè)計(jì)的PROTAC可以有效降低皮膚和脾的IRAK4的水平,并可以減少皮膚變厚,循環(huán)Th1和Th17細(xì)胞因子達(dá)到局部激素治療的水平,口服給藥具有良好的耐受性。


  針對(duì)STAT3開(kāi)發(fā)了PROTAC分子,KYM-003在細(xì)胞實(shí)驗(yàn)、動(dòng)物試驗(yàn)均表現(xiàn)出較好的效果。


  目前所有產(chǎn)品均在臨床前研究階段,還未進(jìn)行臨床試驗(yàn)。


  C4 Therapeutics:


  企業(yè)成立于2015年,專(zhuān)注于技術(shù)平臺(tái)Degronimid。該平臺(tái)開(kāi)發(fā)的小分子一方面可以與靶標(biāo)蛋白結(jié)合,另一方面可以與細(xì)胞內(nèi)的泛素蛋白酶體系統(tǒng)(UPS)中的蛋白相結(jié)合,促使UPS系統(tǒng)為靶標(biāo)蛋白加上泛素的標(biāo)簽。


  團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)來(lái)那多胺等鄰苯二甲酰亞胺類(lèi)抗腫瘤藥物,可以特異性結(jié)合E3連接酶CRBN,通過(guò)PROTAC技術(shù),可以選擇性降解目標(biāo)蛋白比如BRD4,活性達(dá)到皮摩爾級(jí),并有很好的成藥性。


  Nurix Therapeutics:


  企業(yè)成立于2014年,由泛素蛋白酶體系統(tǒng)(UPS)領(lǐng)域的國(guó)際公認(rèn)專(zhuān)家創(chuàng)立。


  研發(fā)管線專(zhuān)注開(kāi)發(fā)用于免疫介導(dǎo)的疾病和血液癌癥的藥物,包括免疫腫瘤療法。


  前沿的產(chǎn)品線包括用于B細(xì)胞惡性腫瘤的口服BTK嵌合靶向分子(CTM)、口服的CBL-B連接酶抑制劑,兩種候選產(chǎn)品均來(lái)自Nurix的DELigase?靶向蛋白質(zhì)調(diào)節(jié)平臺(tái),目前均處于臨床前研究階段。


  Nurix已與多家公司建立了合作關(guān)系:2015年同celgene達(dá)成了合作開(kāi)發(fā)協(xié)議,Nurix負(fù)責(zé)候選化合物的篩選和臨床Ⅰ期試驗(yàn),重點(diǎn)放在E3泛素連接酶配體的選擇和開(kāi)發(fā)上;2019年與吉利德達(dá)成23.45億美元的全球戰(zhàn)略合作;2020年與賽諾菲達(dá)成25億美元的戰(zhàn)略合作。


  藥明康德:


  公司在2014年開(kāi)始建立了全球領(lǐng)先的PROTAC藥物發(fā)現(xiàn)和測(cè)試平臺(tái),賦能眾多全球“長(zhǎng)尾客戶(hù)”。


  2019年,公司 PROTAC平臺(tái)來(lái)自于生物技術(shù)公司客戶(hù)的收入已經(jīng)達(dá)到 4.74 億元,同比增長(zhǎng)約90%。


  針對(duì)PROTAC分子建設(shè)了較完善的統(tǒng)一化賦能平臺(tái),集發(fā)現(xiàn)、合成、分析純化和測(cè)試等能力于一體。


  分迪科技:


  公司成立于2014年,由國(guó)內(nèi)第一個(gè)生物分子模擬方向論壇(BioMS.org)的創(chuàng)始人及其精英創(chuàng)辦。


  目前已建立了一個(gè)獨(dú)特的早期PROTAC新藥發(fā)現(xiàn)平臺(tái),利用該平臺(tái)已完成5類(lèi)蛋白降解PROTAC的篩選與設(shè)計(jì),并且已有多個(gè)案例證實(shí)了其針對(duì)降解靶點(diǎn)篩選苗頭化合物的能力。


  目前與多家制藥企業(yè)和醫(yī)院建立合作,但還沒(méi)有臨床申報(bào)的PROTAC藥物,正處于早期篩選階段。


  凌科藥業(yè):


  成立于2017年,聚焦腫瘤、免疫、炎癥等疾病領(lǐng)域。


  公司的資深創(chuàng)始人有著技術(shù)優(yōu)勢(shì):萬(wàn)昭奎有過(guò)建立靶向蛋白降解平臺(tái)的經(jīng)驗(yàn);汪俊多年前就研 究過(guò)Ras;Michael Vazquez和萬(wàn)昭奎在藥物設(shè)計(jì)上有非常豐富的經(jīng)驗(yàn)。


  目前公司PROTAC研發(fā)管線仍處于藥物發(fā)現(xiàn)階段,暫未申報(bào)。


  開(kāi)拓藥業(yè):


  2009年創(chuàng)立,以雄激素受體相關(guān)疾病為核心,覆蓋全球高發(fā)病率癌癥及其它未滿(mǎn)足臨床需求的疾病領(lǐng)域,包括前列腺癌、乳腺癌、肝癌和脫發(fā)等。產(chǎn)品管線包含小分子創(chuàng)新藥、生物創(chuàng)新藥及聯(lián)合療法。


  公司正大力發(fā)展PROTAC技術(shù)平臺(tái)。2019年9月,公司完成4500萬(wàn)美元融資主要用于三個(gè)方面:繼續(xù)推進(jìn)和完成創(chuàng)新藥物,特別是普克魯胺和福瑞他恩在中美兩國(guó)的后期臨床開(kāi)發(fā);加速新型蛋白降解藥物(PROTAC)和成藥困難的c-Myc抑制劑的研發(fā);以及完成在蘇州的創(chuàng)新藥產(chǎn)業(yè)化基地的建設(shè)。


  五元生物:


  成立于2015年。其主要研發(fā)方向有抗腫瘤新藥研發(fā)、人工智能類(lèi)器官大數(shù)據(jù)樣本庫(kù)的建立運(yùn)營(yíng)、精準(zhǔn)醫(yī)療和仿生醫(yī)學(xué)、生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)的知識(shí)產(chǎn)權(quán)交易和資本運(yùn)作。


  五元生物與戰(zhàn)略合作伙伴共同擁有4條高價(jià)值的自主研發(fā)產(chǎn)品管線。


  目前構(gòu)建了具有自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的PROTAC平臺(tái),主要應(yīng)用于新一代抗非小細(xì)胞肺癌新藥研發(fā),并用類(lèi)器官技術(shù)為PROTAC分子的提供有效性和安全性評(píng)估。


  目前,NWY001產(chǎn)品正在臨床Ⅰ/Ⅱ期階段。


平臺(tái)2


風(fēng)險(xiǎn)提示:

1)新型藥物篩選技術(shù)發(fā)展存在不確定性;

2)新型藥物篩選研發(fā)平臺(tái)梳理尚不完善;

3)各研發(fā)平臺(tái)相關(guān)公司梳理尚不完善;

4)行業(yè)政策變化超預(yù)期。


本文僅代表作者觀點(diǎn),不代表本站立場(chǎng)。

(責(zé)任編輯:李碩)

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